Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrygdP04342 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CrygdP04342 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrygdP04342 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrygdP04342 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms