Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01664 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01664 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01664 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01664 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01664 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01664 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01664 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01664 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
P01664 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01664 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01664 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P01664 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P01664 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01664 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01664 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01664 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
P01664 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
P01664 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01664 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01664 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01664 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01664 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01664 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01664 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
P01664 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01664 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01664 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01664 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01664 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01664 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01664 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01664 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01664 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01664 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01664 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01664 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01664 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01664 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01664 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01664 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01664 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
P01664 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01664 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01664 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01664 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01664 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01664 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01664 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01664 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
P01664 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01664 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01664 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01664 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01664 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01664 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01664 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01664 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01664 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01664 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01664 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01664 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01664 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms