Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna2P01573 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna2P01573 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms