Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odc1P00860 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odc1P00860 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odc1P00860 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odc1P00860 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odc1P00860 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odc1P00860 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odc1P00860 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odc1P00860 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odc1P00860 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odc1P00860 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odc1P00860 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Odc1P00860 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odc1P00860 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odc1P00860 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odc1P00860 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms