Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2bO89051 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms