Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx8O88983 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx8O88983 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx8O88983 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx8O88983 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx8O88983 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx8O88983 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx8O88983 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx8O88983 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx8O88983 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx8O88983 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx8O88983 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms