Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BlmO88700 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BlmO88700 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BlmO88700 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BlmO88700 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BlmO88700 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BlmO88700 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
BlmO88700 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BlmO88700 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
BlmO88700 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
BlmO88700 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BlmO88700 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BlmO88700 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BlmO88700 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
BlmO88700 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BlmO88700 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BlmO88700 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
BlmO88700 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BlmO88700 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BlmO88700 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
BlmO88700 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BlmO88700 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BlmO88700 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BlmO88700 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BlmO88700 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
BlmO88700 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BlmO88700 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BlmO88700 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BlmO88700 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BlmO88700 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BlmO88700 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BlmO88700 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BlmO88700 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BlmO88700 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BlmO88700 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BlmO88700 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
BlmO88700 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BlmO88700 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BlmO88700 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
BlmO88700 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
BlmO88700 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
BlmO88700 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BlmO88700 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BlmO88700 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BlmO88700 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
BlmO88700 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BlmO88700 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BlmO88700 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
BlmO88700 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BlmO88700 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
BlmO88700 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
BlmO88700 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BlmO88700 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BlmO88700 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
BlmO88700 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
BlmO88700 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
BlmO88700 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
BlmO88700 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
BlmO88700 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BlmO88700 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BlmO88700 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
BlmO88700 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
BlmO88700 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BlmO88700 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BlmO88700 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BlmO88700 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BlmO88700 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BlmO88700 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BlmO88700 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BlmO88700 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BlmO88700 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BlmO88700 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
BlmO88700 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BlmO88700 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
BlmO88700 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BlmO88700 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BlmO88700 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BlmO88700 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BlmO88700 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BlmO88700 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BlmO88700 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BlmO88700 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
BlmO88700 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BlmO88700 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BlmO88700 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BlmO88700 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BlmO88700 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BlmO88700 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
BlmO88700 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BlmO88700 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BlmO88700 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BlmO88700 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BlmO88700 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BlmO88700 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BlmO88700 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BlmO88700 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BlmO88700 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BlmO88700 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BlmO88700 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BlmO88700 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms