Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn2O88552 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn2O88552 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms