Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cfdp1O88271 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cfdp1O88271 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms