Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra6O70491 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra6O70491 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra6O70491 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra6O70491 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra6O70491 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stra6O70491 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra6O70491 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra6O70491 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra6O70491 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms