Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Vamp4O70480 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Vamp4O70480 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vamp4O70480 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms