Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cer1O55233 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cer1O55233 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cer1O55233 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cer1O55233 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cer1O55233 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cer1O55233 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cer1O55233 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cer1O55233 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cer1O55233 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cer1O55233 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cer1O55233 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cer1O55233 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cer1O55233 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cer1O55233 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms