Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja1O55176 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja1O55176 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pja1O55176 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja1O55176 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja1O55176 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja1O55176 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pja1O55176 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pja1O55176 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja1O55176 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja1O55176 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pja1O55176 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms