Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn5O54942 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn5O54942 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn5O54942 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn5O54942 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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