Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f6O54917 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f6O54917 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f6O54917 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f6O54917 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f6O54917 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms