Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SpibO35906 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpibO35906 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpibO35906 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpibO35906 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpibO35906 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpibO35906 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpibO35906 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpibO35906 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpibO35906 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpibO35906 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpibO35906 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpibO35906 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpibO35906 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpibO35906 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpibO35906 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpibO35906 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpibO35906 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpibO35906 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpibO35906 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpibO35906 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpibO35906 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpibO35906 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpibO35906 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpibO35906 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpibO35906 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpibO35906 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpibO35906 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpibO35906 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SpibO35906 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SpibO35906 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SpibO35906 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SpibO35906 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SpibO35906 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpibO35906 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpibO35906 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpibO35906 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SpibO35906 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpibO35906 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpibO35906 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpibO35906 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpibO35906 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SpibO35906 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpibO35906 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpibO35906 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpibO35906 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpibO35906 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpibO35906 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpibO35906 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpibO35906 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpibO35906 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpibO35906 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpibO35906 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpibO35906 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpibO35906 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpibO35906 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpibO35906 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpibO35906 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpibO35906 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SpibO35906 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpibO35906 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpibO35906 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpibO35906 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpibO35906 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpibO35906 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpibO35906 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpibO35906 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpibO35906 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpibO35906 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpibO35906 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpibO35906 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpibO35906 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpibO35906 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpibO35906 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpibO35906 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpibO35906 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpibO35906 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpibO35906 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpibO35906 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpibO35906 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpibO35906 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpibO35906 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpibO35906 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SpibO35906 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SpibO35906 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpibO35906 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpibO35906 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SpibO35906 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpibO35906 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpibO35906 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpibO35906 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpibO35906 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpibO35906 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpibO35906 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpibO35906 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpibO35906 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpibO35906 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpibO35906 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpibO35906 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpibO35906 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms