Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rabep1O35551 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rabep1O35551 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rabep1O35551 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms