Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnxbO35452 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnxbO35452 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnxbO35452 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnxbO35452 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnxbO35452 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TnxbO35452 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnxbO35452 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms