Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf5O35445 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf5O35445 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms