Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-ObO35424 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-ObO35424 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms