Protein–RNA interactions for Protein: O35295

Purb, Transcriptional activator protein Pur-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PurbO35295 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PurbO35295 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PurbO35295 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PurbO35295 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PurbO35295 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PurbO35295 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PurbO35295 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PurbO35295 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PurbO35295 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PurbO35295 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PurbO35295 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PurbO35295 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PurbO35295 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PurbO35295 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PurbO35295 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PurbO35295 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PurbO35295 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PurbO35295 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PurbO35295 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PurbO35295 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PurbO35295 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PurbO35295 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PurbO35295 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PurbO35295 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PurbO35295 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PurbO35295 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PurbO35295 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PurbO35295 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PurbO35295 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PurbO35295 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PurbO35295 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PurbO35295 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PurbO35295 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PurbO35295 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PurbO35295 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PurbO35295 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PurbO35295 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PurbO35295 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PurbO35295 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PurbO35295 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PurbO35295 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PurbO35295 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PurbO35295 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PurbO35295 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PurbO35295 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PurbO35295 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PurbO35295 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PurbO35295 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PurbO35295 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PurbO35295 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PurbO35295 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PurbO35295 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PurbO35295 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PurbO35295 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PurbO35295 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PurbO35295 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PurbO35295 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PurbO35295 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PurbO35295 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PurbO35295 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PurbO35295 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PurbO35295 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PurbO35295 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PurbO35295 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PurbO35295 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PurbO35295 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PurbO35295 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PurbO35295 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PurbO35295 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PurbO35295 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PurbO35295 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PurbO35295 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PurbO35295 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PurbO35295 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PurbO35295 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PurbO35295 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PurbO35295 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PurbO35295 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PurbO35295 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PurbO35295 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PurbO35295 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PurbO35295 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PurbO35295 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PurbO35295 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PurbO35295 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PurbO35295 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PurbO35295 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PurbO35295 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PurbO35295 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 313.7 ms