Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Nedd9O35177 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nedd9O35177 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Nedd9O35177 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Nedd9O35177 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Nedd9O35177 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nedd9O35177 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd9O35177 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd9O35177 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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