Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scarb2O35114 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarb2O35114 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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