Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vwa3bJ9JI28 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vwa3bJ9JI28 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms