Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm8356J3QPD3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8356J3QPD3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8356J3QPD3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms