Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6176J3QK59 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6176J3QK59 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6176J3QK59 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6176J3QK59 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6176J3QK59 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6176J3QK59 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6176J3QK59 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6176J3QK59 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms