Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm17535J3KMR8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17535J3KMR8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17535J3KMR8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms