Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20828J3KMI7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20828J3KMI7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Gm20828J3KMI7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Gm20828J3KMI7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Gm20828J3KMI7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Gm20828J3KMI7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20828J3KMI7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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