Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r194J3JS27 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r194J3JS27 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r194J3JS27 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms