Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pot1bH7BX60 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pot1bH7BX60 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pot1bH7BX60 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pot1bH7BX60 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms