Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pabpc4lG5E8X2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pabpc4lG5E8X2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms