Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r67G5E8C1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms