Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Obox6G3X9U1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Obox6G3X9U1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Obox6G3X9U1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 535 ms