Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NpcdF8VQB8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NpcdF8VQB8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms