Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zc3h7bF8VPP8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h7bF8VPP8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zc3h7bF8VPP8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h7bF8VPP8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms