Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh18E9Q9Q6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdh18E9Q9Q6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh18E9Q9Q6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms