Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc146E9Q9F7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc146E9Q9F7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms