Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Arhgef5E9Q7D5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Arhgef5E9Q7D5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Arhgef5E9Q7D5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Arhgef5E9Q7D5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Arhgef5E9Q7D5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms