Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5M4

Zfr2, Zinc finger RNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfr2E9Q5M4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfr2E9Q5M4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfr2E9Q5M4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfr2E9Q5M4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms