Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20518E9Q548 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20518E9Q548 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20518E9Q548 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms