Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrp3E9Q1T6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms