Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r68E9Q0V3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r68E9Q0V3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms