Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30bE9PVL6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30bE9PVL6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30bE9PVL6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30bE9PVL6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30bE9PVL6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30bE9PVL6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30bE9PVL6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30bE9PVL6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30bE9PVL6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms