Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp944E9PUS4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp944E9PUS4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp944E9PUS4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms