Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AU019823E9PUQ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AU019823E9PUQ3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AU019823E9PUQ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.7 ms