Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Soga1E1U8D0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Soga1E1U8D0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Soga1E1U8D0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Soga1E1U8D0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms