Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc8D3YZV8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc8D3YZV8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc8D3YZV8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms