Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc13D3YV10 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc13D3YV10 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc13D3YV10 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms