Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700015F17RikD3YUK8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms