Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc5C3VPR6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc5C3VPR6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc5C3VPR6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms